Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms