Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem88Q9D0N8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms