Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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RpainQ9CWY9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RpainQ9CWY9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RpainQ9CWY9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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