Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nup37Q9CWU9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms