Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ddx28Q9CWT6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ddx28Q9CWT6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddx28Q9CWT6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddx28Q9CWT6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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