Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms