Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atxn3Q9CVD2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms