Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2Q9CUU3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms