Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rer1Q9CQU3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rer1Q9CQU3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rer1Q9CQU3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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