Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd5Q9CQP3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms