Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms