Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DenrQ9CQJ6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DenrQ9CQJ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms