Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms