Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cntnap4Q99P47 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cntnap4Q99P47 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cntnap4Q99P47 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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