Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atoh8Q99NA2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Atoh8Q99NA2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atoh8Q99NA2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atoh8Q99NA2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms