Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrtQ99MR6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrrtQ99MR6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms