Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smtnl1Q99LM3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms