Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lysmd3Q99LE3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms