Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms