Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms