Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PpifQ99KR7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms