Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms