Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed9Q99KF1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms