Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SmagpQ99KC7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms