Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms