Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk9Q99J95 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdk9Q99J95 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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