Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf112Q96DY5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf112Q96DY5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms