Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf3Q922U1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms