Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip1Q922J3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms