Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms