Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1bQ91YK2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms