Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdhb12Q91Y07 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdhb12Q91Y07 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms