Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco4Q91WU4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms