Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms