Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms