Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpap2Q8VC34 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpap2Q8VC34 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpap2Q8VC34 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpap2Q8VC34 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpap2Q8VC34 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpap2Q8VC34 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms