Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms