Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C8

Vmn1r18, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r18Q8R2C8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r18Q8R2C8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r18Q8R2C8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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