Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnf183Q8QZS5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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