Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms