Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prpf39Q8K2Z2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms