Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms