Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnppd1Q8K158 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnppd1Q8K158 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms