Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FgbQ8K0E8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FgbQ8K0E8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms