Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkn3Q8K045 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkn3Q8K045 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms