Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc4a8Q8JZR6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a8Q8JZR6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms