Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms