Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms