Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Upp2Q8CGR7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms