Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms